UMR_C 5242 - Institut de génomique fonctionnelle de Lyon (IGFL)

L'IGFL développe des approches de génomique fonctionnelle et d'intégration biologique pour comprendre les processus développementaux, évolutifs et physiologiques. Les interfaces sont encouragées, entre la biologie évolutive, le développement et  la physiologie.
Nous nous intéressons à la génomique fonctionnelle, c'est à dire à la compréhension des mécanismes génétiques et moléculaires qui permettent aux animaux de se développer correctement et de s’adapter à leur environnement et au fonctionnement du génome dans ces processus. L'IGFL regroupe des biologistes moléculaires, des embryologistes, des généticiens, des endocrinologues, des bioinformaticiens, des évolutionnistes, des biologistes cellulaires, des paléontologues, des physiologistes et des spécialistes du génome.

Les recherches à l’IGFL sont orientées en trois axes :

• Génomique de l'adaptation et de la macroévolution
Cet axe vise à déchiffrer la cause ultime des phénomènes ou des processus biologiques. Les méthodes de génomique fonctionnelle et la modélisation sont utilisées pour comprendre les bases génétiques de la diversité et de l'adaptation des animaux. Ce domaine couvre les différentes disciplines de l’évolution : paléontologie, évolution moléculaire, écologie évolutive,  biologie évolutive du développement, génomique et  morphologie comparative. Une grande variété de modèles animaux est utilisée, vertébrés et invertébrés, vivants ou fossiles.

• Mécanismes de développement et de régénration
Cet axe se concentre sur la compréhension des principes généraux de la biologie du développement et de la régénération. Les recherches sont principalement basées sur la génétique d’espèces modèles vertébrées et invertébrées,  et l’analyse multiéchelle des phénotypes. Au niveau moléculaire, l’analyse génomique permet d’identifier  les principaux réseaux et  voies de signalisation qui orchestrent l'expression des gènes. La microscopie permet d’analyser dynamique cellulaire qui sous-tend les processus de morphogénèse et de  régénération.

• Physiologie intégrative et physiopathologie
Cet axe traite des différents aspects de la physiologie en allant de leur élaboration au cours du développement tardif,  jusqu’à leur altérations dans des situations pathologiques. Les thèmes principaux touchent à l’endocrinologie, aux rythmes biologiques, et aux relations entre animaux et microbiote. Plusieurs équipes combinent les études in vivo de modèles animaux et in vitro de modèles cellulaires pour aborder  ces questions.

Équipes de recherche :

  • Vieillissement, reproduction et métabolisme.
  • Biologie comparative du développement et de la régénération.
  • Neurodéveloppement.
  • Génomique du développement et évolution.
  • Zoologie moléculaire.
  • Génomique fonctionnelle des interactions Hôte/Bactéries.
  • Ontogénèse et interactions moléculaires.
  • Biologie et pathologie des matrices extracellulaires.
  • Génomique fonctionnelle des récepteurs nucléaires.
  • Physiopathologie des récepteurs nucléaires orphelins.
  • Évo-dévo de la denture chez les vertébrés.
  • Génomique évolutive des poissons.

 

Site web unité : http://igfl.ens-lyon.fr/

École(s) doctorale(s)
ED 340 - Biologie moléculaire, intégrative et cellulaire
Établissements co-accrédités : Université Claude Bernard Lyon 1