Le conseil d’administration compte 40 administrateurs, dont 16 représentants du personnel et des étudiants y compris des doctorants, 18 représentants des membres à parité entre établissements d’enseignement supérieur et de recherche, 2 personnalités qualifiées et 4 représentants des tutelles. Le corps électoral de l’Institut rassemble une communauté de 27 000 personnes, constituée des personnels et étudiants des membres. Il est organisé en 8 collèges : étudiants (1), doctorants (1), directeurs de recherche, chercheurs, autres catégories de personnel (3), professeurs, maîtres de conférence, autres catégories de personnel (3)
Le conseil d’administration fixe les orientations générales de l’Institut et délibère après avis du conseil des membres.